按照中心《科室年度考核实施方案（试行）》和《2011年度科室考核标准》，2011年12月21-23日，由中心三名调研员、行政办公室、党办人事科及业务科组成的考核组，通过听取科室汇报、查看资料以及结合平时工作的方式对中心10个业务科室、5个行管后勤科室开展了年终考核。
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在听取了各科室的年终总结及来年工作思路汇报后，考核组认为，2011年是“十二五”开局之年，也是实施绩效工资的第一年，各科室没有受到绩效工资的影响，而是按照中心“十二五”规划的要求，认真开展各项工作，圆满完成了各项指令性工作任务，工作成效显著，为实现“十二五”规划目标奠定了良好的基础。
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工作中，各科室在完成常规工作的同时，不断创新工作思路，如艾防科积极打造艾滋病定点治疗医院，建立了艾滋病防治新的模式，结防所、卫生检验科努力创建省级重点实验室和市级重点专科，积极开展与国家疾控中心科研项目合作，全方位提高科室业务水平，门诊体检、疾控二科、职放科全年体检人数远远超过去年同期水平，疾控一科继续强化传染病防控，举办了专题培训9次，确保了传染病发病水平较去年同期有所下降，健康教育所在完成全年控烟目标任务和省级卫生城市复评工作的同时，继续强化信息建设，保持了全省外网建设一等奖，各科室技术服务总量均超过去年同期水平等。同时，科室向中心反馈如用车难、科室硬件设施需加强等问题，考核组认真听取了科室意见，鼓励科室合作，后勤科室为业务科室服好务，为领导当好参谋，共同为全面提高中心水平，打造区域优势疾控中心而努力。
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